Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPF3BQ9BZI7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms