Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms