Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCO2Q9BYV7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BCO2Q9BYV7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms