Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms