Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PI4K2AQ9BTU6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms