Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD2Q9BSE4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms