Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms