Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms