Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF5Q99942 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF5Q99942 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF5Q99942 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms