Protein–RNA interactions for Protein: Q96N21

TEPSIN, AP-4 complex accessory subunit Tepsin, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEPSINQ96N21 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEPSINQ96N21 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEPSINQ96N21 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms