Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms