Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms