Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDLIM2Q96JY6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms