Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC8Q96B26 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC8Q96B26 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms