Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms