Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms