Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms