Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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