Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF439Q8NDP4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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