Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCSAMQ8N6F7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms