Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM71E2Q8N5Q1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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