Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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