Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC47Q8N1G4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms