Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EID3Q8N140 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms