Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms