Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC29A4Q7RTT9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms