Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms