Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms