Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCD3Q6STE5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms