Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF613Q6PF04 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF613Q6PF04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms