Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms