Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms