Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms