Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C10orf55Q5SWW7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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C10orf55Q5SWW7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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C10orf55Q5SWW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C10orf55Q5SWW7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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