Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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