Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms