Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR44Q5JSH3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms