Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms