Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms