Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDCA8Q53HL2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms