Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms