Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM1Q2NKQ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms