Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRNQ16849 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRNQ16849 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPRNQ16849 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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