Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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