Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PCSK7Q16549 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PCSK7Q16549 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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