Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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