Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms