Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK1Q15118 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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