Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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