Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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